1. 轉基因生物（GMO）檢測
- 基因序列特異性驗證：通過PCR或測序確認CpTI基因在轉基因作物中的整合位置及拷貝數。
- 表達水平定量：使用qRT-PCR或Western Blot檢測CpTI蛋白的表達量，評估抗蟲效果。
- 環境安全評估：檢測基因漂移風險及對非靶標生物的影響。
2. 醫學研究中的CpTI相關檢測
- 基因工程載體構建驗證：在基因治療或藥物遞送系統中，檢測CpTI作為功能模塊的完整性和表達效率。
- 病理機制研究：探索CpTI類似蛋白酶抑制劑在癌癥、炎癥性疾病中的作用，例如通過敲除/過表達實驗分析其對腫瘤侵襲的影響。
- 生物標志物篩選：檢測血液或組織中CpTI同源物的表達水平，評估其與疾病預后的關聯性。
3. 表觀遺傳學檢測（如CpTI啟動子甲基化）
- 甲基化水平分析：利用亞硫酸鹽測序（BSP）或Methylation-Specific PCR（MSP）檢測CpTI基因啟動子區域的甲基化狀態，研究其對基因沉默的影響。
- 與表型關聯性：例如在轉基因植物中，甲基化可能導致抗蟲性下降，需定期監控。
4. 分子互作與功能驗證
- 蛋白互作網絡：通過Co-IP或酵母雙雜交技術，鑒定CpTI蛋白與宿主（如人類細胞）中靶蛋白的結合能力。
- 酶活性抑制實驗：評估CpTI對特定蛋白酶（如組織蛋白酶）的抑制效率，指導藥物設計。
- PCR/實時熒光定量PCR：用于基因拷貝數、表達量分析。
- 下一代測序（NGS）：全基因組范圍內檢測CpTI的整合位點及突變。
- 質譜分析：精確測定CpTI蛋白的表達豐度及修飾狀態。
- 免疫組化（IHC）：定位CpTI在組織中的分布。
- 農業領域：植物葉片、種子DNA/RNA。
- 醫學領域：細胞系、血清、組織活檢樣本。
- 流程：樣本采集→核酸/蛋白提取→靶標檢測→數據分析→報告生成（含閾值判斷及建議）。
- 農業：確保轉基因作物符合法規要求，降低生態風險。
- 醫學：為基因治療載體設計提供質量控制，或發掘新型疾病治療靶點。
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